Gobernanza Colaborativa es un programa perteneciente a la Corporación Municipal Innova San Joaquín, que tiene por objeto gestionar acuerdos, alianzas y convenios de colaboración con instituciones públicas y privadas con el objetivo de crear beneficios para la comunidad de San Joaquín. Entre los proyectos que se gestionan están las clínicas jurídicas para atención gratuita, operativos de salud, actividades culturales y donaciones de productos de higiene y belleza para la comunidad.